实践中的以鉴代审问题主要体现在两个方面:一是凡是涉及建设工程价款或者质量问题，都要求当事人申请鉴定；二是只要鉴定机构出具了鉴定意见，就一律按鉴定意见处理，对于双方争议事项不作分析判断。

鉴定机构出具的鉴定意见只是帮助法官对专业问题作出判断的参考意见。有的情况下， 无须专业意见法官就可以作出判断，则不必要求当事人申请鉴定。有的情况下，是否采纳鉴定意见，采纳鉴定意见中的哪些部分，需要法院根据当事人举证、质证、辩论的情况以及鉴定人员出庭接受询问的情况作出判断。